Įprasta, kad apsilankymas muziejų fonduose lankytojams negalimas. Atnaujinant muziejų, buvo rastas sprendimas – stiklo siena, už kurios esančius fondo eksponatus gali matyti žmonės. Be to, lankytojams atviros tapo ir muziejaus restauratoriaus dirbtuvės. Čia vyksta edukacinės programos, kurių metu iš arčiau galima išvyksti medžio eksponatų restauravimą. Patenkama tik ekskursijų metu.
Viename iš Tauragės pilies bokštų įsikūrusi fotografijos galerija, kuriai pradžią davė tuometinis muziejaus fotografas Romualdas Vaitkus. Nuo pat įsikūrimo 2003 metais galerijoje rengiamos žymiausių Lietuvos fotomenininkų, spaudos fotografų, bei vietos fotografų parodos.
Krašto gamtos įvairovė pristatoma Gamtos ekspozicijoje, kuri suskirstyta į šešias zonas. Paukščiai, žinduoliai, gyvos egzotinės ir vietinės žuvys, gamtos atspindžiai, bestuburių namelis bei poilsio zona.
Praėjus abiem pasauliniams karams Tauragės miestas liko ypač nuniokotas, bokšto rūsyje veikia instaliacija „Dingusi Tauragė“. Čia ypatingas dėmesys skiriamas tikrovei imituoti: niūri aplinka, besimėtančios imitacinių ginklų nuolaužos ir azoto dūmai leidžia pasijusti taip, lyg slėptumėtės bunkeryje, o virš mūsų vyktų karas.